La Fondazione nasce per iniziativa di Francesco Baggi Sisini, da tempo impegnato in attività filantropiche a sostegno di associazioni culturali, della ricerca scientifica e delle persone che vivono in uno stato di disagio. Nel 2021, con i fratelli Carlo, Maria Antonietta e Giorgio, dà vita all’istituzione con il fine di definire una linea d’intervento unica, quella delle «collaborazioni solidali».
In questa logica, già nel corso del 2020, a seguito dell’emergenza sanitaria Covid-19, ha provveduto a una donazione a supporto della sanità milanese, a un fondo a tutela dei propri dipendenti e collaboratori, a un fondo per aiutare le piccole imprese e gli anziani della provincia di Sassari, sua città di origine.
La Fondazione Baggi Sisini opera prevalentemente sui territori di Milano e Sassari con iniziative a supporto della formazione, della ricerca medica e della cultura.